办理医疗器械三类经营许可证要完成以下流程：

1、经营范围要有“销售医疗器械”

2、网申提交医疗器械材料

3、药监窗口提交三类材料（携带原件），等待通知核查

4、领取医疗器械许可证（若有二类，提交材料，当天下备案单）

Zui后明晰办理医疗器械三类经营许可证有效期、办理期限：

1、三类的有效期限：5年

2、二类备案单：没有有效期

3、办理时间：材料受理后的5个工作日

1. 准备申请材料：根据《医疗器械监督管理条例》和相关规定，准备好相关的申请材料，包括企业法人营业执照、产品质量管理体系文件、产品注册证明、产品技术文件、产品使用说明书、生产许可证明等。

2. 自查准备：对企业内部的质量管理体系进行自查，确保符合医疗器械相关的质量管理要求，如生产工艺、生产设备、人员素质、质量控制、设备检测等。

3. 咨询指导：可以在中国国家药品监督管理局（CFDA）的guanfangwangzhan上查询相关政策和流程，也可以联系北京市食品药品监督管理局或相关部门了解详细的申请要求和指导。