三类医疗器械经营许可证办理方式如下：
（1）申请人提交申请资料到相关部门；
（2）相关部门受理申请人的申请；
（3）到实际场地进行勘察以及对产品进行审核；
（4）准予颁发三类医疗器械许可证。

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一、申请条件:申请《医疗器划经营企业许可证》应当同时具备下列条件:

(一)具有与经营规模和经营范围相适应的质量管理机构或者大专学历以上质量管理人员两个，质量管理人员应当具有家认可的相关学历或者职称;

(二)具有与经营规模和经营范围相适应的相对独立的经营场所

(三)具有与经营规机和经营范围相适应的储存条件，包括具有符合医疗器械产品特性要求的储存设施，设备

(9)应当量立健全产品席量管里制度，包活采得，讲货会收，仓程保等，出库着核，质量银踪制度和不度事件的报告制商等