三类医疗器械经营许可证办理方式如下：
（1）申请人提交申请资料到相关部门；
（2）相关部门受理申请人的申请；
（3）到实际场地进行勘察以及对产品进行审核；
（4）准予颁发三类医疗器械许可证。

品药品监督管理局关于发布<北京市医疗器械经营监督管理办法实施细则>（2017年修订版）的通告》（北京市食品药品监督管理局 通告[2017]25号）6．《 国家食品药品监督管理总局关于施行〈医疗器械经营质量管理规范〉的公告》（2014年第58号）期限：自受理之日起30个工作日（不含送达期限） 受理范围：本市行政区域内企业申请从事第三类医疗器械经营的，由企业住所所在地区食品药品监督管理局或北京市食品药品监督管理局直属分局受理。  许可程序：一、申请与受理条件企业登陆 北京市食品药品监督管理局企业服务平台进行网上申报( 网上填报指南)，企业根据受理范围的规定，需提交以下申请材料：1．《 医疗器械经营许可申请表》；2．营业执照复印件（交验原件）； 3．法定代表人、企业负责人、质量负责人的身f证明、学历或者职称证明复印件；（交验原件） 4．组织机构与部门设置说明； 5．经营场所、库房的地理位置图、平面图（注明面积）；库房的产权证明及使用权证明复印件；（委托贮存的，应提交经营场所地理位置图、平面图（注明面积）和与被委托方签署的书面协议复印件、被委托方的《医疗器械经营许可证》复印件） 6．经营设施、设备目录； 7．经营质量管理制度、工作程序等文件目录； 8．计算机信息管理系统基本情况介绍和功能说明； 9．凡申请企业申报材料时，具体办理人员不是法定代表人或负责人本人，企业应当提交《 授权委托书》；10．申报材