办理医疗器械三类经营许可证要完成以下流程：

1、经营范围要有“销售医疗器械”

2、网申提交医疗器械材料

3、药监窗口提交三类材料（携带原件），等待通知核查

4、领取医疗器械许可证（若有二类，提交材料，当天下备案单）

Zui后明晰办理医疗器械三类经营许可证有效期、办理期限：

1、三类的有效期限：5年

2、二类备案单：没有有效期

3、办理时间：材料受理后的5个工作日

营业执照由工商局颁发，每年年检。而经营许可证，是法律规定的某些行业必须经过许可，而由主管部门办法的许可经营的证明，如烟草专卖许可等。营业执照是每个开门做生意的经营者都需要办理的证件，没有这个证件，就是无照经营行为，是违法的。经营许可证是做某种方面的生意所必须取得的证件，这个证件必须在办理营业执照之前取得，也就是所谓的前置许可审批文件，例如卖烟的话，需要在办营业执照之前取得《烟草零售经营许可证》，卖食品需要在办营业执照之前取得《食品流通许可证》，开饭店，搞餐饮服务的，需要在办营业执照之前取得《餐饮经营许可证》，不一而就。