三类医疗器械经营许可证办理方式如下：
（1）申请人提交申请资料到相关部门；
（2）相关部门受理申请人的申请；
（3）到实际场地进行勘察以及对产品进行审核；
（4）准予颁发三类医疗器械许可证。

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医疗器材经营许可证申请流程:

(一)申请

申请人持申报资料向省，自治区、直辖市人民政府药品监督管理部门提出申请，

(二)受理

电指资料技限食品药元公务管理局政务大厅，经审查，申话二项有法量千本部门责范电，申报资制符合机定些庆的，予以零理，并十展《四理请知书》

对申报资料存在可以当场更正的错误的，允许申请人当场更正，对申报资料不齐全或不符合要求的，在5个工作日内发给申请人《补正资料通知书》，一次性告知

申请人品要扑正的全部内容:申请事项优法不属于本部门职专范围的，出具《不予要理通知书》

办理时限:5个工作日，

(三)审查、审批

对申报资料进行初审后，按照《医疗器用经营企业资格认可实施细则》组织验收，符合法定条件、标准的，依法作出准予许可的书面决定:不符合规定的

出具不予许可的书面决定，并说明理由，同时告知申请人享有依法申请行政复议或提起行政诉讼的权利，

办理时限:30个工作日，

(四公示，制证、送达